这年年底，王实味被隔离审查。随着审干运动的展开，１９４３年４月１日晚，中央社会部正式逮捕了王实味，将其关进了社会部看守所。但是，毛泽东此时也明确指示：对王实味“不要放也不要杀”，“不得擅自处理”。显然，毛泽东是很明白王实味问题的本质的。当时，要整或要纠正的并不是王实味这个人，而是一股思潮。
经过一段监牢生活后的王实味，精神上完全垮了。毕竟，他是一个思维会转过不停的知识分子，而不是无知亦无多少思想的鲁莽之徒。虽然，看守所确未对他用刑讯，但监牢中各方面都毕竟不比外面自由天地，从来就自由惯了的王实味在里面是不可能精神不垮的。因而，在后来的审干运动中，始终不认错的他，突然变成了一个极度认罪供罪悔过的人，在监牢中，他还胡乱承认自已是托派中央委员兼中央宣传部副部长，还参加过托派的“十月社”，等等。
不过，对此，连社会部的审讯人员也不相信，而只视他是脑子有毛病了。
１９４３年夏末，１９４４年夏初，先后有二批中外记者访问延安，因王实味的问题已在国民党统治区内传得沸沸扬扬，甚至都说他早已因《野百合花》文章被处死，所以有不少记者要见见王实味。记者的要求都被允许了，他们也都见到了尚还活着的王实味。但是，王实味那种木然承认自已是托派分子、是犯过错误而受到宽大“在休养”等现场情况，还是让一些记者（包括时任《新民报》著名记者的赵超构）看出了王的神经已有些不正常。但，王实味的确还活着这一事实，毕竟是真的了。
