大会一致通过了新的党纲，即《六一年纲领》。这个纲领纠正了日本共产党原有理论的错误和偏差，重新认识和总结了日共40年来的斗争经验，指出“工人阶级的历史使命是走社会主义道路。只有通过革命……粉碎以美帝国主义和日本垄断资本为核心势力的反动统治”，才能“实现真正的独立，在政治、经济、社会等方面实现彻底的民主改革。”[2-2]
第一，关于战后日本国家的性质。新纲领认为，“日本是介于西欧和亚洲之间的国家”。“现在，从根本上统治着日本的是美帝国主义以及同它结盟的日本垄断资本集团。日本虽然是高度发达的资本主义国家，但又是在国土和军事等方面受到美帝国主义掌控的附属国。”
第二，关于日本革命的性质和道路。新纲领规定：“当前的革命是反对美帝国主义和日本垄断资本两个敌人的新民主主义革命、人民的民主革命”。它以“争取独立和民主为中心任务”，又是“向社会主义发展的过渡阶段”。两个阶段之间具有“不断革命”的必然联系，而社会主义革命是“以消灭资本主义制度”为主要任务的。新纲领公布以后，日共又进一步明确，两个阶段的革命都是走“和平与民主的道路”，也就是走“选举和议会斗争的道路”，并且把这样的革命称作“人民议会主义”或“多数人的革命”。
第三，关于日本革命的方法。新纲领指出，“组成反对美帝国主义和垄断资本统治的人民统一战线”。党和工人阶级领导的这个民族民主统一战线，要积极地取得国会议席，并同国会外的群众斗争结合起来。新纲领认为，如果在国会中拥有稳定的过半数，就能够把国会从反动统治的机关变成为人民服务的机关，合法地建立统一战线政府，使国会成为名副其实的国家最高权力机关。
