1936年11月，国民党政府以危害国民罪先后将邹韬奋、沈钧儒等七人逮捕。据传蒋介石曾邀他“当面一谈”，被邹韬奋拒绝。三年后，邹韬奋在重庆获知，蒋介石欲收他做“文胆”陈布雷第二。
1938年底，邹韬奋再次赴渝，此行的目的是将生活书店由武汉迁到重庆。生活书店下设图书、刊物和报纸等业务。
在重庆，邹韬奋最常拜访的衙门是图书杂志审查委员会。该委员会对生活书店“审查”严格，唯恐“异端”言论流毒坊间。
虽然屡次拜访通融，图书杂志审查委员会并没有手下留情，这个最无法搞暗箱操作的部门不敢拿自己的乌纱帽玩火。到1941年2月，除了重庆分店之外，生活书店在国统区内的50余家分店全部被当局封闭，所有职工被逮捕或遣散。
相反，1941年2月23日，在第二届国民参政会第一次会议开幕之前，邹韬奋自摘国民参政员乌纱帽，黯然南下香港。
原国务院副总理、邹韬奋之子邹家华对父亲南下后的境况历历在目：“他（邹韬奋）当时是国民参政会的参政员。皖南事变发生后，国民党把56个生活书店都封闭了。他在重庆没法待下去，就从重庆跑到香港去了。在这个过程中，我已经年纪大了些，读到初中二、三年级，对国民党迫害的情况知道了一些。父亲走了以后，母亲住在城里，国民党特务天天去。父亲没走的时候，他写文章、办书店，参加政治活动，我们虽然知道，但了解得不多。星期六、日回到城里的家里，碰到日本飞机轰炸，父亲就带着我们一家人跑到沈钧儒侄子家的防空洞去躲警报。我们住的地方和陈果夫的家在一块儿，一个院子进去，一幢房子陈果夫住，另一幢是我们三家一起租的。我们住在楼下；楼上一家姓周，他的儿子比我大一点，在南开高中，另外还有一家。”
