1995年3月23日，朱令接受气管切开手术，并做了气胸手术。
1995年3月24日，协和医院在查不出病因的情况下，对朱令采用血浆置换疗法，前后8次，每次均在1000cc以上的换血量。换血对于维持她的生命还是起到作用的，只是令她感染了丙肝。
1995年3月25日，朱令出现吸氧不稳定，幸好守护在侧的父亲及时发现，才避免了一次危情。
1995年3月26日，转入重症监护室，接上呼吸机，当时是按急性散播性脑脊椎炎治疗。
两天以后，朱令陷入长达数个月的深度昏迷症状。
在住院期间，她被要求各种检查，从肾穿刺、脑活组织检查，有些损伤太大，被家属拒绝。但是却一直没有进行金属检测，只是检查过砷中毒，被排除。（《三联生活周刊》2001）
1995年3月底，朱令宿舍的一个女同学给吴承之打了个电话，告诉他：“朱令剩下的面包，我们几个分了吃了。”
“很明显，有人在销毁证据，”吴承之向记者回忆这个细节时强调。
(来源：《法制周报》2006年1月26日)
目前未查明到底是谁打的电话，是孙维、刘庆、周欣之一，或是其他女生冒名室友？
这个电话可以有两种理解。
第一种理解：如果凶手销毁证据，为什么特意通知朱家呢？当时并未查明病因，也无人怀疑是投毒，凶手可以偷偷扔掉面包，事后若有人问起，就说过期或者发霉了即可，为什么还要特意通知一声？所以，不管吃没吃，或许这个打电话的室友只是出于善意，想告诉朱令父母这个面包的结局，算作对他们的安慰：它的归宿不是垃圾桶。
