一项观察性研究表明，高摄入omega-6脂肪（例如亚油酸）与炎症性肠病（IBD）的风险更高。富含omega-6脂肪的食物，例如亚油酸包括：
家禽、牛油、面包、蛋、起司、红肉、二十二碳六烯酸（DHA）等omega-3脂肪摄入量增加，表明IBD风险降低。Omega-3含量高的食物包括：
亚麻、冷水鱼、坚果类、种子、有人说，简单的omega-3鱼油膳食补充剂可以减少暴发。不幸的是，没有足够的科学证据来支持这种说法，但是服用omega-3补充剂的人不太可能使他们的症状恶化。任何服用补品的人都应该记住在食物日记中注明它们。
纤维
纤维也对克罗恩氏病有影响。人类无法消化纤维。相反，肠道中的细菌会吃掉它。一种理论认为，饮食富含纤维的人可能会增加肠道细菌的多样性，而这些多余的细菌可能会减少与克罗恩氏病有关的炎症。
许多患有克罗恩病的人发现，高纤维饮食可以缓解症状，但不幸的是，几乎没有临床证据可以证明这一点。
低残留饮食
低残留饮食是基于这样的想法，即减少食物在消化后留下的“残留”量将减轻IBD的症状。“残渣”是指在每次排便时不会被消化并增加粪便量的物质，例如纤维。低残留饮食还限制了某些乳制品和肉制品。
由于低残留饮食可以减少通过消化系统发炎区域的粪便量，因此提倡者认为这可以减轻症状。但是，最近很少有临床证据表明，除非通过短期流质饮食，否则减少膳食纤维将有助于克罗恩氏症。
面筋不耐症
发表给密涅瓦胃肠病学和饮食学的一项研究发现，患有腹腔疾病的人患克罗恩病或其他类型IBD的可能性比其他人高10倍。患有腹腔疾病的人对面筋有严重的自身免疫反应。研究人员指出，患有克罗恩氏病但未患有乳糜泻的人更容易遭受麸质的不良反应。这表明无麸质饮食对患有克罗恩病的人可能有用。
克罗恩病的微生物群调节
目前，科学家正在研究不健康的肠道细菌在诸如克罗恩氏病等炎性疾病中起关键作用的可能性。尽管缺乏科学证实，但《世界胃肠病学杂志》发表的最新评论表明，调节肠道菌群可以缓解许多肠道疾病的症状。
可以通过不同的方式来改变肠道中的菌群，例如将益生菌，益生元，抗生素和更多的纤维引入饮食。该报告表明，益生菌的效果最差，但它们仍显示出改善症状的迹象，例如腹泻。对这些物质有反应的人应将其记录在饮食日记中另一种治疗方法是粪便微生物移植，包括用供体的健康粪便细菌替换坏细菌。
