阿贝尔在美国一住多年,直到一九五五年才返回苏联,小住数月,领受新任务。那时阿贝尔供职的所属机构,已经更名为克格勃。当时,克格勃领导鉴于阿贝尔成绩卓著,拟为他派去助理,以便更好地完成任务,于是,克格勃报务员海翰嫩(Reino Häyhänen)奉命前往。熟料,海翰嫩是个立场极不坚定的侦察员,他经不住美国生活方式的诱惑,在价值观上发生动摇,有时,他甚至不仅不协助阿贝尔完成任务,而且还拖后腿,迟滞工作进展,克格勃很快得知海翰嫩的表现,决定让它返回莫斯科。可是,就在海翰嫩离职返国前夕,突然向美国国家安全机构自首,供出了克格勃搜集美核武器研发的秘密情报计划,还将阿贝尔及其下线全部出卖。
阿贝尔于一九五七年,在纽约“拉塔姆”酒店( Latham Hotel),被美国联邦调查局便衣逮捕。苏联不仅从此失去了一位优秀国际侦察员,而且赫鲁晓夫那时还对外宣称,说苏联从来不搞国际间谍活动,因此,阿贝尔在美国被捕,对苏联政权而言,不啻于自打耳光。再说阿贝尔被捕后,一直隐瞒其真名费舍尔,坚称他的本名就是阿贝尔,这是他与克格勃临行前的秘密约定,他想以此证明,尽管被捕入狱,也未出卖组织,背叛苏联。跟据后来美国所披露的档案,阿贝尔被捕后,不仅拒绝承认其在美的间谍行为,而且还拒绝了美方间谍机构的利诱。
阿贝尔被捕,是美国反间系统取得的重大成果,美方一直将他关押在单人牢房,严加看管,直到当年,即一九五七年,法庭宣布判处他三十二年监禁之后,才将其押解至亚特兰大联邦监狱看管。入狱服刑后的阿贝尔,不仅钻研数学问题和艺术理论,而且还从事油画创作。苏联前克格勃主席谢米恰斯特内(Владимир Семичастный),曾经透露,阿贝尔所画的肯尼迪肖像,是为这位美国总统的最爱,他向阿贝尔求画,阿贝尔欣然允诺,肯尼迪获赠后十分开心,并将此画悬挂在美国总统椭圆形办公室。