延安时代，同甘共苦，官兵一等的色彩淡化了，共产主义供给制下的不平等，更显得突出，关于一般战士，青年学生的吃穿在王实味的文章中也反映出来，文章称：“青年学生一天只得两餐稀粥”，“害病的同志喝不到一口面汤”。延安的官僚主义、特权等级、享乐主义开始盛行，对此，王实味十分反感，称为“到处乌鸦一般黑”。这一句话的确伤了毛泽东，天下乌鸦一般黑，不就是拿延安和蒋介石的重庆比的吗？毛泽东看了文章后，大发雷霆，严厉指出：“这是王实味挂帅了，不是马克思主义挂帅。”又在整风高级干部总结会上说：“丁玲是同志，王实味是托派。”在另一场合说：“《野百合花》有文章。”事后在1945年七大时毛说：“他（指王实味）是总司令，我们打了败仗。我们承认打了败仗，于是好好整风。”1942年6月起展开了对托派王实味的批判并且不断升级扩大。
康生的插手使得这件事情向一个更加恶劣的政治事件演变。后又被定为托派分子，并与延安中央研究院、中央政治研究室的其他4人，一起被打成“五人反党集团”。1942年被开除党籍。1943年被逮捕关押。1943年4月1日被康生下令逮捕，1946年重新审查结论是“反革命托派奸细分子”。1947年3月延安保卫战开始，王实味被转移押往兴县城郊晋绥公安总局的一个看守所。不久此地遭到国民党轰炸，看守所需要转移，行前请示对于王实味的处置办法，王震将军亲自批复指示将王实味就地秘密处死。晋绥公安总局审讯科于7月1日夜将王实味提出，砍杀后置于一眼枯井掩埋。时年四十一岁。
