进化论者常用的一个较为完备的进化谱系证据是脊椎动物序，包括从鱼类到两栖类，爬行类，鸟类，哺乳动物，直至人的进化。
从鱼类
到两栖类
，曾发现
一种叫Rhipidistian的鱼化石
，其骨骼特征
类似于两栖类
，因此被认为是鱼类
到两栖类
的过渡类型
。但当另一种叫Coelacanth的活化石
发现后，这种观点被立即推翻
，因为这两种动物在进化谱系中的亲缘关系是极近的
，但研究表明
，Coelacanth并无任何上岸的可能性
。曾经轰动一时
的始祖鸟
，曾被视为进化论的铁证
，因为
它即具有爬行动物的特征
，又具有鸟类的特征
而被视为一个著名的过渡类型
。后来发现
，始祖鸟
所具有的爬行类特征
，如爪
和牙齿
，在现代鸟类
中也存在
，也就是说这个证据并不能用于判定鸟类与爬行类的过渡类型
。另外，早在1977年《科学
》上发表
的一篇论文
指出，与始祖鸟
同一地层
出土的化石
被怀疑
为近似于现代鸟类动物
