“逻辑循环
”。
现代基因学和遗传学诞生后，对生物体形态与功能的关系在更本质的层次——基因及分子水平有了崭新的认识。形态和功能只是表相，它们是由基因决定的，相同的形态可能对映于完全不同的基因。
如果认为从鸟类的翅膀到哺乳动物的前肢是进化的话，那么它们的基因也应表现为对映于形态相同程度的进化。但实际上并非如此，如果现在仍有人试图从表面现象说明问题，只能被认为是肤浅的。
（二）古生物学
。
1.凌乱的化石证据。
无论是进化论者还是反进化论者，都希望古生物化石能辅证自己的观点。
如果说达尔文时代缺少化石记录
，那么迄今为止
，人类已收集了数以万吨计的化石
，是否已证明进化论
的正确性
？事实上依然不能
。古生物学家
Raup本是进化论者
，但后来不得不放弃自然选择学说
，而支持幸运者生存说
，他说现有已知化石物种
的近五分之一，可是已经确证
的中间过渡类型的化石
比达尔文时代
还少。现有化石记录混乱不堪，人为按进化论组成的谱系漏洞百出，根本不能说明问题。
进化论者们所使用的分类方法及标准又不同，因此对某一化石的断代也经常争论不休，没有一个统一的结论。
