就其光路来分有两种：
1．
1．
透射式荧光显微镜
激发光源是通过聚光镜穿过标本材料来激发荧光的(图2—5)。常用暗视野集光器，也可用普通集光器，调节反光镜使激发光转射和旁射到标本上．这是比较旧式的荧光显微镜
。其优点是低倍镜时荧光强，而缺点是随放大倍数增加其荧光减弱．所以对观察较大的标本材料较好。
2．落射式荧光显微镜
这是近代发展起来的新式荧光显微镜
，与上不同处是激发光从物镜向下落射到标本表面，即用同一物镜作为照明聚光器和收集荧光的物镜(图2—6)。光路中需加上一个双色束分离器，它与光铀呈45。角，激发光被反射到物镜中，并聚集在样品上，样品所产生的荧光以及由物镜透镜表面、盖玻片表面反射的激发光同时进入物镜，反回到双色束分离器，使激发光和荧光分开，残余激发光再被阻断滤片吸收。如换用不同的激发滤片／双色束分离器／阻断滤片的组合插块，可满足不同荧光反应产物的需要。此种荧光显微镜
的优点是视野照明均匀，成像清晰，放大倍数愈大荧光愈强。
（二）使用方法．
1．打开灯源，超高压汞灯要预热几分钟才能达到最亮点。
2．透射式荧光显微镜
需在灯源与聚光器之间装上所要求的激发滤片，在物镜的后面装上相应的阻断滤片。落射式荧光显微镜
需在光路的插槽中插入所要求的激发滤片／双色束分离器／阻断滤片的插块。
