君士坦丁堡宗主教区于一九九六年在香港和东南亚建立都主教区。然而,君士坦丁堡宗主教区的主教公会却在二零零八年重新划分香港都主教区范围,将中华人民共和国、台湾地区和东南亚其他国家也划入其都主教区。俄罗斯东正教教会主教大会于当年即宣布,中华自治东正教教会是其不可分割的、合乎教规之区域,同时强调了捍卫中华自治东正教教会之教权的立场,此番宣言与二零零八年四月十五日主教公会宣言的立场完全吻合。
上海的大司祭米哈伊尔(王泉生)神父、大辅祭伊凡格尔(卢亚夫)在二零零八年五旬节终于得到中国官方同意,在将近半个世纪之后,他们首次在俄罗斯驻上海总领馆内,与俄罗斯神父阿列克谢一道主持事奉礼仪,这成为当年中华自治东正教教会最重要的历史事件之一。次年,即二零零九年八月,中国内蒙古自治区拉布达林镇纪念俄罗斯伊尔库茨克的英诺肯提教堂圣化仪式举行,这座建了将近九年的教堂终于揭幕,上海的米哈伊尔(王泉生)神父主持了圣化仪式,该教堂所需的一切物品,包括法衣、圣像壁和事奉礼仪必备物品都是经过俄罗斯东正教教会主教公会同意,征得中方宗教局的批准从俄罗斯赤塔和后贝加尔教区运抵当地的。
二零零九年十月十三日,在北京,俄罗斯驻华使馆(原俄罗斯中国传教团属地北馆)举行了至圣诞神女教堂圣化仪式,教堂的二楼还为传教团制作了常年的展览,实际上是传教团博物馆和教堂图书馆。十一月,俄罗斯联邦总统办公厅和俄罗斯东正教教会外联局联合代表团,应中国国务院宗教局的邀请访华。代表团团长是伊拉里昂大主教,他担任俄罗斯东正教教会外联局局长和俄罗斯联邦总统办公厅宗教联合协调委员会成员。俄罗斯代表团访华期间举行了俄华宗教合作谈判,这是两国首脑会晤期间所商定的俄罗斯联邦与中国二零零九年至二零一二年睦邻、友好与合作协议所确定的项目。