然而，无论是以自然方式分界还是历史方面形成的传统分界，南北的主导线主要还是以秦岭—淮河为界。所以，秦岭—淮河就成为中国传统意义的南北分界线。现在，中国不少省份建立了“中国南北分界”标志，其中安徽淮安市在一座桥上建设的“中国南北分界标志”最为壮观，就基于这方面的考虑，当然，最主要的目的是为了炒作旅游热点。
但是，以秦岭—淮河为线分中国南北现在也陷入了瓶颈，尤其是随着各省、市、自治区对于旅游的重视，对于中国南北分界线的划分更是有自己的标准，于是，质疑秦岭—淮河为中国南北分界线的声音就越来越大，一方面秦岭是一个庞大的山系，虽然东西绵延1600公里，但它南北纵横数百公里，这数百公里如何划分？而秦岭以西呢？又该如何划分？而淮河虽然有约千公里长，在中国算得上一条大河，但它很难称得上是一条独立的河流，大运河中下游就是以淮河下游为主干开凿出来的，联结的是长江，这样，淮河实际上没有下游，大运河向东只有南北数十公里的无数水网来支撑，无法分辨哪条河才能算作淮河的下游，而且淮河主要的河水南下注入长江，这样，淮河也就实际上成为了长江的支流，主要水流南下进入长江，那大运河以东的地区该如何划分南北呢？所以，秦岭—淮河作为中国的南北分界线也有缺陷，至少有很大面积的盲区。
更何况，以农作物为区分南北现在同样陷入尴尬，如现在的东北也种植水稻；如果按照湿润和半湿润地区来区分，东北部分地区明显属于湿润地带，而且与800毫米年降水量没有必然的联系，因为东北气温偏低，蒸发量不大，更何况，东北原始森林遍布；如果按水田旱地划分也没有充足的道理，因为谁都知道，中国的旱地主要集中于中原一带，而中原一带主要集中旱地的根本原因其实是水资源不丰富。
