恐怖主义在全世界遭谴责，一个重要原因是，它冷酷地伤及无辜，以残暴的手段无差别地对待平民。恐怖主义在全球肆虐以来，人们必然要讨论一个问题：恐怖主义源头来自哪里？这个问题多少有点敏感。法国《查理周刊》惨案发生后，大多数国家的政要和媒体都只提恐怖主义，少数国家和领导人直言不讳地指向伊斯兰教。窗户纸捅不捅破，大家其实都心照不宣。事实上，早在拉登成为全球瞩目人物时，很多西方学者、政治家、媒体评论者就已经指出：恐怖主义与伊斯兰原教旨主义有密切关联，伊斯兰原教旨主义被认为是恐怖主义的温床。这个说法很有欺骗性。
“查理惨案”发生后，有媒体指出，法国发生的这起严重恐怖袭击事件，犹太人是重要的目标之一。据报道，死亡的4名人质都是犹太人。然而，以色列的一家报纸一方面谴责伊斯兰恐怖主义，另一方面又发文章回忆历史上犹太教与伊斯兰教和平共处的年代。原教旨主义从其命名就可以看出它主张复兴旧传统，既然如此，伊斯兰原教旨主义为何不复兴与犹太教和平相处的传统呢？其实，伊斯兰教创始人默罕默德在创教之初就与犹太人关系不错，在伊斯兰圣地麦地那周围，当时就住着不少犹太人。那么，伊斯兰原教旨主义为何不遵循默罕默德的行为规范呢？恐怖主义起源于伊斯兰原教旨主义说法值得质疑。
首先，原教旨主义最初出现于美国基督教的新教，时间大约是两次世界大战之间，当时的目的之一就是反对达尔文。基督教新教的原教旨主义至今在美国社会依然有较大的影响。源自美国的基督教原教旨主义在理论上反对现代主义、自由主义和世俗主义。这种宗教情绪很快影响了受西方现代化冲击的其他宗教，例如犹太教和伊斯兰教。犹太原教旨主义和伊斯兰原教旨主义也随即产生。因此，伊斯兰原教旨主义的源头实际上来自西方社会。追根溯源，如果说伊斯兰恐怖主义与伊斯兰原教旨主义有密不可分的关系，那么，结论也只能是：恐怖主义源自西方文明内部。
