江泽民在谈话中宣布了一个布什最为关心的信息。他说：“出于人道主义考虑，中国政府决定允许美方机组人员离境。这一事件并未完全了结，希望美方认真对待中方的立场，妥善处理。” 4月11日，布什委托美国驻华大使普理赫作为全权代表向中国递交致歉信。从后来公布出来的资料中，人们知道在这封信里，布什和鲍威尔对中国飞行员失踪和飞机坠毁都表示了真诚的遗憾。 普理赫代表美国政府向中国人民和王伟的家属深表歉意，并就美方飞机未经许可而进入中国领空和降落中国机场向中国深表歉意。很多人注意到，布什和鲍威尔用的词语是“遗憾”，而普理赫用了“歉意”一词。 4月16日美国谈判小组乘飞机到达北京。在谈判中，中国方面明确表示，不同意EP-3直飞美国，并不意味着中国不同意归还飞机，这要看美国方面的态度。 美国原打算对飞机进行修复后飞回美国，遭到中国的反对后，CBS的报道说，五角大楼现在打算将这架飞机的机翼切下，用美国的C-5等大型运输机或由第三国的运输机如俄罗斯的伊尔-76运回美国。
7月5日，俄罗斯大型安-124运输机将被拆解后的美国EP－3侦察机运抵美国洛克希德"马丁公司在佐治亚州的修理工厂。
