但在张献忠死后 13年的1659年，清军才攻陷重庆。这相隔的13年中，清军在与谁作战？学者们推论：张献忠余部及四川人民和清军展开了搏斗。清军在这13年中将四川人不分兵民地进行了大屠杀。 学者们还通过一份清军1649年的公告佐证这一猜想：“民贼相混，玉石难分。或屠全城，或屠男而留女。” 史乱 新南门挖出枯骨坑天府广场成动物乐园 对以上两种观点，郑光路说，崇祯十七年(1644)年初，张献忠杀进四川。同年9月9日攻进成都，建大西国。 后清军逼近成都。“张献忠晓得大势已去，纵火烧成都‘成焦土’。两千年的古城，尽毁张献忠之手。”郑光路表示：“李劼人也说：‘元兵之残毒，也从未能像张献忠这样……一干二净！’我在《“张献忠剿四川”真相》一书中，也用大量真实史料证明了这一点。” 他随后又翻开了曾亲历乱世的沈荀蔚写的《蜀难叙略》，书中说：
“时成都城中绝人迹者十五六年，惟见草木充塞，麋鹿纵横。”也就是说，“当时的成都城实际上已变成超级野生动物园，虎狼出没，人迹荒芜”——连以前巍峨无比的蜀王府内(现市中心天府广场一带)也草茂林密。 史料更记载了非常惊人的一幕：清军1659年带领一些陕西移民进入成都，还可以在老皇城中打到野味！ 郑光路说：“大西皇帝逃离成都前，又开始了一场中外历史上极其罕见的大屠杀。张献忠令士兵挖掘许多大坑，活埋百姓……2002年，成都新南门修路时惊现‘万人枯骨坑’，‘随处可见散乱的骷髅、腿骨……凌乱地堆放在工地。’” “张献忠进入四川3年，给四川造成了极大的破坏，使得川西平原减少了近200万人口。”郑光路对张屠四川的理由，认为是他在占据成都后堕落为耽酒好色的“西朝皇帝”，不谋发展，只是不断在自己“国家”内“杀鸡取卵”一样地抢掠、剿杀，满足自己的欲望和军队的给养。
