作为一位科学家，林建华先生应该知晓质疑在科学活动中的作用。不过，也许“屁股决定脑袋”，在什么职位就会有什么样的想法，林先生在校长的位置上最担心的恐怕是学生“闹事”，比如学生对学校的行政事宜提出质疑，要求信息公开等。在北大这样一个有着浓郁自由主义传统的地方，任何来自学生的风吹草动都可能酿成校长难以控制的局面。从这个角度来看，校长呼吁同学少焦虑、勿质疑，一门心思“走向未来”似乎也就不难理解了。
需要指出的是，在现代文明社会，质疑的精神无论怎样强调都不算过分，因为质疑所反映出来的不同正是社会所需，更是物质世界本质的一部分，也是世界丰富多彩的体现。不要质疑，没有思想，不仅会令科学以及其他所有人类创造活动瞬间窒息，恐怕社会也会是一潭死水，毫无生机。对人类文明稍有知识的人都知道，大到一个社会，小到科学探索，几乎能够想到的一切进步都是在不断质疑的声浪中艰难前行的。
让我们暂时跳出上述争议。北大校长的道歉其实还牵扯出两个更为广泛的话题：一是，中国如何建立一种道歉乃至引咎辞职的文化；二是面对社会舆论危机时，如何公关？
从一般意义上看，道歉是一种担当，也是一种负责任的行为。然而，环视当今中国，无论对个人而言，还是就政府部门而论，公开道歉其实并不常见。说了错话，做了错事，拒不道歉，采取各种手段搪塞、应付是常有的事。而那些有道歉想法的人，要么担心道歉无益而错失机会，要么因为不得要领而适得其反。总之，中国社会普遍存在着一种不愿道歉，不敢道歉和不会道歉的倾向。
