有人统计，直至今日，莆系医院中最常见仍是男科、妇科、不孕不育。也发展出了整形美容、牙科、眼科和高端产科等更多科目。这些专科共同点是：低风险、高利润、非医保。
曾经有莆田当地人向南方周末讲出其中缘由：“因为性病这东西不敢声张，不好意思在公立医院实名登记，而且哪怕治坏了，也认个倒霉，不会跟别人说，所以他们能从里面发财”。
这也导致莆田系声名狼藉。而多年来，莆田系与多年来游走在政策边缘，习惯了小心翼翼，躲藏在背后，通常以“集团”的方式建立或购买医院，聘请医生和院长，自己完全隐身。
国家卫计委网站显示，截至2014年7月，全国民营医院11830家，从事医疗产业莆田人6万人，兴办的民营医院8000多家。莆田（中国）健康产业总会旗下会员单位达到数千家。
莆田系和百度关系密切，也曾闹得不可开交。2015年3月，百度官方对莆田系医疗商态度强硬，表示不会动摇“高门槛、严审核”决心，并加大整治以莆田系为代表的违规医疗推广。”
网上传闻，莆田(中国)健康产业总会发出通知，称“网络竞价规则导致医疗机构沦为为互联网打工，严重影响医疗机构的成长，其号召全体乡亲停止对百度的有偿网络推广活动。
莆田系医疗商敢于公开叫板百度的原因在于，莆田系医疗商占据中国民营医院的80%份额，2014年给百度贡献的收入超过100亿元。
百度对莆田系爱恨交织原因在于，莆田系贡献了大量的广告收入，但莆田系医疗有很多不正规，甚至坑害患者的行为，导致百度经常遭遇外界抨击，百度CEO李彦宏被指赚“黑心钱”。
不过，百度很难割舍医疗广告，也很难绕过莆田系。分析人士指出，莆田系渗透到民营医院和武警医院的方方面面，在百度追求高额利润的情况下，很难说百度只是“无辜躺枪”。
