三是科研与科研经费使用混乱，成为高校一个重要的腐败之源。
高校科研与科研经费使用成为全国政协委员议论的热点话题。某高校花六千万买设备，放了5年都没拆包；科研经费年底花不完，就包一个酒店消费，一桌几千上万的吃。按照有关规定，科研经费中的15%用于项目负责人的消费，国家科委400亿的科研经费，意味着60亿用于个人消费了，他们买东西全能报销。
科研经费提成制度，使有些科研人员拿到经费，马上就把三四成资金装进口袋。随着科研经费增加，一些科研人员很容易成为暴发户。科研经费一到学校，上面就难管了。年底集中花钱，花几千块上万块吃一顿饭。跟谁吃，很多都是跟行政主管部门吃的。如果不是被他们控制着审批权，有求于他们，各高校又相互攀比，谁舍得花这么多钱去吃饭？
个别院士、名流做项目就挂个名，因为没有他就申请不到资金。项目一到手，经费一大块就被他提走了，事情交给下面的人做，成果出来了，又是他的名字。这种风气也是学术领域的腐败。大学每年拿到经费的多少，已经成为一种衡量标准。多拿一点，对公对私都有好处，个人可以提成，学校可以作为成绩。在这些利益驱动中，不但有经济效益，还有荣誉，甚至有政治利益。
这几年查办的科研经费贪腐案中，很多人的毛病就是突击花钱，拿到经费后就要买电脑，不知道电脑到底买没买，但明细上都有显示，买了，到底需不需要总换电脑？没买，钱到底用哪去了？
