一旦某个相关机构，证明某人是个严格的学者，才能被获准进入其中，学者们会索取他们想参考的具体文件，每天仅允许索取三份文件。因此，比起浏览档案室的目录，他们必须从用意大利或拉丁文手写的目录中选择出具体文章。电脑是可以带进去的，但是不允许摄影，所以，学者们大部分时间都在阅览室里快速码字。
档案室有80公里长的书架，和追溯到八世纪的各类文件，仅可供参考的目录就有35000卷。在2012年，为了庆祝建馆400周年，100多份秘密文件被公之于众，这次展览被称作“神秘之光”，其中包括有关1633年对伽利略的审判的相关记录。
二、现代梵蒂冈机密档案室
