维护正统 被夷十族
文皇（即明成祖，朱棣）登基称帝，姚广孝了解方孝孺，破城之前，曾请求朱棣，称看重气节的方孝孺不会轻易归顺，希望手下留情不要加害，否则天下读书种子绝矣。《明史·方孝孺列传》记载：
成祖发北平，姚广孝以孝孺为托，曰：“城下之日，彼必不降，幸勿杀之。杀孝孺，天下读书种子绝矣。”
朱棣问姚广孝：“谁可以起草继位诏书？”广孝回答，只有方孝孺行，于是朱棣命人召他来。经过数次的往返征召，方竟然不肯前来，最后派人强行挟持他入朝上殿，方却披麻带孝，一路神情哀凄悲哭不止。既到内殿，朱棣令他起草即位诏书，他更是大声号泣，誓死不从，再三强迫他执笔，他一再丢掷不拿，口中的骂声益发严厉，说：“再怎么样，也不过诛杀我九族而已！”成祖听了，更是愤怒，说：“朕就决定夷汝十族。”左右问：“多的是哪一族？”皇上说：“他的朋友也算一族啊。”于是尽杀与方孝孺有牵连的九族人性命，而且大肆搜索天下所有与方为友的人，一并杀之。
先祖杀生 贻误后人
方希直（孝孺，字希直）祖先墓茔，起初传说有妖孽祸乱，后来决定修治坟墓，一打开，发现一条巨蟒从坟冢中爬出，那巢穴里，繁殖力极为惊人，蛇子蛇孙大约有数千条，沿着洞穴广布攀爬、四处盘踞，腥臭的秽气，逼人欲呕。
众人决议，想尽数歼灭它们，所以暂且先把那巢穴掩盖上然后回家，再各自整治些梃（木杖叫梃）、（大锄叫）等火攻的器具。那个晚上，方公祖父梦见有位黑衣老妪拜见，再三恳切的讲：“吾辈没做什么有损于公之事，公打算一举歼灭我的族众，倘若您能舍弃此计划，我们当报您以德，不然的话，我们也能以怨相报哪。”
