2014年4月，王成、钟山、苏君红和周立伟四位工程院院士联名给国家安全委员会上书，为褚健陈情。
2014年8月，浙江省检察院反贪局完成侦查后制作了起诉意见书，移送检察院审查起诉，主要罪责集中在2003年校企产权私有化过程中的问题。
2015年2月，检察院对褚健提起公诉，检方认为褚健方受让的股权涉嫌侵吞国有资产，存在贪污以及行贿行为。从侦查机关调查的情况看，褚健在担任浙大副校长8年的时间里，未涉贪腐问题，转移资产纯属子虚乌有，褚健个人生活也没有问题。举报信和起诉书差别巨大。
今年6月16日，法院通知，褚健案再次延长审限三个月。该案已经被延期五次，至今尚未开庭。
有人说，褚健案敏感，今天是褚健，明天会是谁，没出事的人怕不怕？当然，这不是同情褚健的理由，别人没有被追究，不等于不能追究褚健，但也决不能造成冤假错案。
那么，褚健到底有没有侵吞国有资产？由于采用收益鉴定法(用该股权交易未来若干年的预期收益，而得出当年的股权价值)，得出褚健当年收购价格过低，褚健的律师给出一个比喻：“把一个蛋孵成了鸡，让鸡生蛋，继而养成了鸡场。现在，有人找你算账说那只蛋卖便宜了。”长期研究企业发展史的吴晓波则说：“官方从来都没有公布过非违规法则，但企业的发展需要产权的清晰，谁都在违规，可是只有一两个人被处罚，这就是制度性的问题。”
和王石那时的谨慎不同，1992年邓小平南巡讲话后，数以百万计的国有企业进行了非国有化改革，造成国有资产严重流失的情况恐怕不胜枚举。同样是科研院所改制成科技公司，联想改制、东软改制，都是从1993年启动，那时确实是“摸着石头过河”，同样是1993年，褚健受命创办了浙大工业自动化公司，这也是中控系的前身。
