唐僧的调整仅只是个引子，新版《西游记》最大的调整还在于他的结构和立意。谋篇布局上，对每个故事都添加了解读。唐僧离开车迟国前不忘教育国王“追求神通，往往走入偏门”，同时顺带教诲徒弟要以虎力大王等为戒，“惟有大仁大勇者，才能立于不败之地”，不要太卖弄神通，别太要强傲慢。这样的解读往往还不失趣味，对于八戒和悟空这对斗嘴冤家的解读就非常有意思，八戒自己都说“一路上要不打打闹闹争争斗斗，也没多大意思”，为此沙僧送给八戒两个字:“犯贱!”诸如此类的解读充斥在每一个故事中，成为每一个故事收官时必不可少的构造。
不仅如此，新版《西游记》对原有故事均重新做了定位和立意。比如“大战红孩儿”，红孩儿从未吃过人，其实也不想吃唐僧，唐僧的几句关怀和教化倒是令这个“懂事的孩子”很受用，红孩儿这个“问题少年”开始被唐僧找出了“病原”，并从根上得以治疗，观众看到最后就明白了，原来红孩儿的问题还是个家庭问题，家教问题，和大闹天宫的孙悟空一样都是一个家教问题(所以最后佛祖给一直叫喊着没人教化的孙猴子配了一个叫唐僧的家庭教师)。又如“火焰山”部分，新版《西游记》还重新解读成了牛魔王与罗刹女还有“小三”玉面狐狸之间的情感问题——说到底也是家庭问题，最后在唐僧的感化下和孙悟空的手下留情中，大圣当年的拜把兄弟及其嫂子终于是一团和睦，破镜重圆。恶斗“青牛”一戏中，编剧更是精心从开篇就给这个故事设计了一个圆，从唐僧走出悟空化缘前给他画下的护身圆，到青牛妖手中那个任凭悟空搬来天兵神将也斗不过的那个圈，再到唐僧教化那妖怪时论道的六道轮回之圆，最后到太上老君出手降妖并给青牛鼻子上套上的那个牛环，整整一个故事都在这个“圆”中，同时引出青牛难耐天庭修炼，下凡欲走修仙捷径，岂料犯下大错的主题——“修行之路不容走捷径”，这也是新版《西游记》最大的主题，显得通情达理。
