检察官宣读完起诉书后，面对指控他分6次收受或通过他人收受贿赂折合人民币3079万元的事实，杨琨不持任何异议。面对检察官和法官的询问，他的主要回答是“没有”以及“具体的我记不清了，以其他人调查时说的为准。”
杨琨还承认，自己所有的受贿，都交给了他妻弟陈某，或是通过陈某完成，而具体拿了多少钱，收了多少东西，他都不看。甚至包括自己年薪接近百万的工资卡，都是交给陈某打理的。他还叮嘱陈某，不要记账，而且不要每一笔都向他汇报。
杨琨简历及案件进展时间表
1983年开始，杨琨在中国农业银行工作，至事发时已有近30年的时间。2004年起任中国农业银行副行长。2008年3月起兼任农银汇理基金管理有限公司董事长。农业银行2011年年报显示，杨琨税前薪酬合计91.56万元。
2012年5月底，中国农业银行发布公告证实，杨琨正协助有关部门调查。一个半月后，农行再度发布公告，称杨琨由于个人原因不能履职，已辞去农行相关职务。
2013年5月20日官方证实，杨琨构成严重违纪，并涉嫌受贿犯罪，被开除党籍公职，收缴其违纪所得，将其涉嫌犯罪问题移送司法机关依法处理。
2014年1月7日，南京市检察院通报，此案已进入公诉阶段。
港币1000万元
行贿人：某地产商
受贿借口：小舅子炒股被套，他让对方帮忙解套
杨琨2004年担任农行副行长后，主要分管房地产信贷部等部门的工作。此后不久，他多年的一个朋友，同时也是在成都投资一个项目的地产商找到他，称在农行四川相关支行的贷款审批通过后，停止下款了，希望他帮忙出面协调。
