其后，发生了银广夏事件，侯宁对市场存在的一些问题开始有了警觉，因此2001年，当吴敬链跟几大经济学家争辩的时候，侯宁写了一篇文章《欢呼声终将响起》，预感6月或7月大级别的调整就会来临，这一次他的文章发表在了中国证券报上。随后，2001年6月开始，股市开始了长达两年的漫漫熊途。
侯宁坦言，当时对于股市的认识和现在不能相提并论，主要是凭市场感觉，加上综合了一些股评家们的观点，从心理学这个角度预测差不多到顶了。
牛市历程：看多—警示—看空
侯宁说，唱空也有很多种，有的是唱空行情的性质，是一种“警示”；有的是唱空股指本身。在这一轮牛市中，侯宁之所以被称为“空头司令”，也正是由于他这两种唱空。
其实这一波大牛市初始，侯宁也是看多的，当时他曾看到3000点。2005年初，侯宁发表了《股市前瞻：“满地金子”还是“一地鸡毛”》；随后，股改破题，在股指跌至998点附近前后，侯宁发表了《我们再也没有理由看空中国股市》《永别了，触摸千点的“一夜情”缘》；2006年3月，侯宁写下《千三必成未来铁底》。
初步给市场留下空头印象，是2005年7、8月间的那波1757点-1547点的调整，200多点的调整在当时还是不小的幅度。侯宁当时发表了股市面临调整的评论，随后股市经历了两个月的调整，但是没有调整到侯宁所看的1400点，10月份以后，市场开始进入一段疯狂的行情，一下子突破了2000点。
