实际上养殖转基因鲑鱼对环境也有正面的影响。由于可以就近在陆地养殖，减少了运输费用和二氧化碳排放。由于养殖的鲑鱼生长迅速，能更好地满足日益增长的市场，也就能减少捕捉野生鲑鱼的压力，反而有助于保护野生鲑鱼。
这些好处是“环保主义者”所忽视的。他们更关心的是虚拟的潜在风险。捕捉或养殖鲑鱼的渔民反对转基因鲑鱼的理由则要实际得多。他们担心的是自己的饭碗。不过，他们的担忧是自相矛盾的：一方面担心由于转基因鲑鱼不加标志地上市，导致人们从此不敢吃鲑鱼，毁掉整个鲑鱼产业；一方面又担心由于转基因鲑鱼价廉物美，导致人们从此只吃转基因鲑鱼，让传统鲑鱼产业破产。
