而证监会新闻发言人称，余额宝中有部分基金销售支付结算账户并未向监管部门进行备案，也未提交监督银行的监督协议，违反了上述两部法规中的相关规定。监管部门已要求支付宝对未备案的基金销售支付结算账户进行补充备案。如果支付宝逾期未进行备案，将根据相应法律规定进行调查处罚。
尽管如此，证监会对于支付宝“余额宝”仍旧表达了肯定态度。上述新闻发言人表示，余额宝为投资者提供了更多投资理财选择，是“市场创新的积极探索”。证监会支持市场创新发展，并为其提供制度保障和宽松环境。
支付宝“余额宝”推出以来就面临争议。除去支付宝涉足基金业务这一话题外，余额宝在宣传资料中一直强调基金的收益，而未对基金投资风险做出提醒，被指误导性宣传。支付宝资深高管总监曾对此在微博做出公开回应，表示将把余额宝的风险提示放置在产品更醒目的位置。
从“阿里小贷”到“余额宝”，阿里巴巴互联网金融领域的尝试一直在继续，马云也从不掩饰自己对金融领域的兴趣。《人民日报》今天也刊登了马云的专访文章，马云在专访中这样说道：未来的金融有两大机会，一个是金融互联网，金融行业走向互联网；第二个是互联网金融，纯粹的外行领导，其实很多行业的创新都是外行进来才引发的。“金融行业也需要搅局者，更需要那些外行的人进来进行变革。”(李云)
