假如病史调查及随后的体检证实造成性交疼痛和性交不能的原因既不是男方因素所致，也不是女方的器质性因素所致，那么，很可能是心理性因素所造成的。从患者个人角度来说，应该注意获得有关她们的整个精神心理状态的详尽的信息，以寻找可能存在的诸如焦虑、抑郁等情感障碍的蛛丝马迹。虽然过去常常把性交疼痛看作是一种外科原因造成的问题，并在上世纪时成为常见的妇科手术指征，但外科干预显然不会取得明显效果。随着本世纪以来心理学科的日益发展及其与多学科的交叉渗透，使得人们对这种性功能障碍有了全新的了解和认识，并提出更合乎逻辑的和更有效的治疗方法。
性交疼痛往往代表着一种严重的心理情感障碍，虽然性欲低下也会造成性交疼痛，但更多更经常的恐怕还是内心和人际因素的复合产物。在这种情形下，治疗显然应以性治疗为主(即心理治疗加上行为治疗)，兼顾妇科检查和专科的特殊治疗，此外，婚姻治疗也有其特别的效果。从人际关系角度说，需要检查性交疼痛给双方和婚姻关系带来的影响。所以单纯依靠标准的妇科治疗措施往往不容易收到明显的效果，至于那些声称除了性关系有问题之外别的什么都好的夫妇，特别要警惕其中潜在的尚未为他们自己所认识到的其他方面的冲突，反之也常见整天争吵不休的夫妻潜在着种种难言的严重的性问题，争吵正是性冲突的外在表现形式，只不过双方都不敢也不愿正视这一问题罢了。有关性交疼痛的主诉往往会使医生忽视或误解她们存在的其他方面的真正困难。
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只有充分认识到性和谐和性相容性重要性的夫妻才会具有较好的预后，他们往往会注意到与建立令人满意的和舒适的性关系有关的许多其他方面的问题。由于性治疗在西方的兴起与日益普及，西方国家的许多夫妻纷纷自行处理和解决他们的程度较轻的性功能障碍，所以目前临床上所见到的性功能障碍要比十几或二十几年前复杂得多。但在国内的情况则恰恰相反，许多夫妻缺乏最基本的性知识，遇到问题又讳疾忌医，结果只能长期默默忍受疾病的折磨，因此在临床工作中向病人进行基本的性教育似乎是很必要的，它是开展正式治疗之前的必修课，医生从问题的发生顺序，对病人自己和对伴侣的影响、就诊前病人寻求过哪些帮助等问题都可以看出病人对所存在障碍的理解程度，也就是说病人对性障碍病因病理有无认识。
