反方观点认为，秦始皇焚书坑儒毁坏了大量的书籍文物，给我国古代文化带来极大地损失。如果打开秦始皇陵，，就能够得到秦始皇焚书坑儒的真相，还能够找到一部分古代书籍。
第二个秘密就是秦二世继位的真相，关于秦始皇究竟传位于扶苏还是胡亥，一直以来都有不同的说法。如果能够打开秦始皇的陵墓，就能够找到秦二世继位时的蛛丝马迹，分析出秦二世究竟是如何继位的。第三个秘密是秦二世是否真的杀害了修建墓穴的匠人，秦始皇陵是否真的有上万美女陪葬。《史记》中记载了秦始皇下葬的时候，秦二世将修建陵墓的匠人，以及秦始皇生前宫中的美女，都关进了墓穴里面。
这个说法一直都有争议，有的人认为这是有人栽赃秦二世，也有人认为这是历史事实。
除了能够揭开这三个秘密之外，秦朝如何灭亡的六国，秦朝时期的风土人情，秦末农民起义的真实原因，这些历史谜团都能够随着秦始皇陵的挖掘而被揭开。挖掘秦始皇陵也能获得大量的珍贵文物，要比挖掘任何一个帝王墓，收获的文物都要多。不过从当前的考古现状来看，秦始皇陵在短期内仍然不会被挖掘，毕竟我们的文物保护技术还不到位，挖掘秦始皇陵在揭开历史谜团的同时，也会给文物造成大的破坏，这样做显然得不偿失。
