事后，党中央、国务院对此高度重视，并要求公安部、浙江省委、省政府迅速破案并且妥善处理善后。浙江省公安机关调集300馀名警力，克服种种困难，在当地群众的大力支持下，昼夜工作，案发后仅17天即侦破了此案，无证从事摩托艇营运的吴黎宏等三人在天黑后持枪登船进行抢劫，随后锁死舱门，炸毁游船。这是一起纯粹的刑事案件，罪犯是社会不法份子，是一伙损人利己、不务正业，从而铤而走险的歹徒，其作案的目的纯粹是为了贪图钱财。6月10日，浙江省高级人民法院在杭州对千岛湖“海瑞号”游船抢劫纵火杀人案被告人吴黎宏、胡志瀚、馀爱军进行了公开审理，宣布判决结果，三名犯罪嫌疑人均以抢劫罪、故意杀人罪罪名被判处死刑，剥夺政治权利终身，1994年6月19日，三名罪犯被执行枪决，不过此案件中并没有关于官员被处理的消息。
