但是，橙黄色的花本身长势较弱，为了获得红色玫瑰的抗病性，你会首先将橙黄玫瑰与红玫瑰杂交，杂交之后颜色的基因会变成杂合子，由于性状不稳定，不利于生物大规模推广。为了得到橙黄色的后代，你只能将杂交后的橙黄色后代与亲本橙黄色回交，这就是第一次回交，此时会有一半的花呈橙黄色。之后，再进行第二次回交，此时会有3/4的花呈橙黄色。一直进行到4-5轮之后，该生物的大多数花都是呈橙黄色，此时性状比较稳定，才具有商业价值。
当然目前回交可以采用更先进的分子标记辅助育种。
对于一年生植物而言，其实并不存在回交的问题，因为该生物只有1年的寿命，无法与后代回交。对于多年生植物而言，回交并没有什么危害，因为许多植物可以通过自交方式繁殖后代，比如：豌豆属于自花授粉。即使因回交或自交产生的病弱性后代，也可以通过人为或者自然脱落的方式终止生长。但是对于动物而言，回交危害比较大，因为动物有感知疼痛的能力，而回交在繁殖时，一些隐性致病性状也会被加固，导致动物患有基因疾病，比如：折耳猫的骨骼遗传病。这些遗传病严重影响生物的生存质量，造成动物活着的每一天都是受苦受罪。
但不幸的是，大多数宠物都面临着近亲繁殖、回交繁殖，这导致作为宠物品种繁殖的猫猫狗狗大多都有基因缺陷。
总结
回交作为一种生物育种手段，本身并没有好坏之分，甚至在合理的情况下，采用回交能够拯救某一个物种。比如：当生物学家遇到某一个物体只有一个或者少数几个个体时，科学家就会使用回交的方式育种。采用回交繁殖的风险在植物上较低，甚至没有危害，但对动物的危害较大，这是因为动物有感知疼痛的能力，而近亲繁殖以及回交有激发隐形致病基因的风险。
