为了使清朝得到汉族官吏的支持,顺治九年(1652年),孝庄皇太后把为清朝战死的汉族定南王孔有德的女儿孔四贞留在身边,加封为和硕格格;太后还敢于冲破满汉不通婚的祖制,于顺治十年(1653年),将皇太极的十四女和硕恪纯公主下嫁吴三桂之子吴应熊。此举使绝大多数汉军将领效忠清廷,也有助于以后康熙平“三藩之乱”的胜利。
顺治十八年(1661年),顺治帝患痘病卧床不起,谁来继承皇位刻不容缓,顺治帝考虑因为皇子年少,准备立皇弟。太后听取了在清廷任职的德国人汤若望提出“因玄烨出过天花,有免疫力,适合继位”的谏言,深思熟虑后,坚持立皇三子玄烨。经太后的极力推荐,顺治帝依从了母后,立诏由皇三子玄烨继位,为清朝选定了一位明君。
康熙二十一年(1682)春,皇帝出巡盛京,沿途几乎每天派人驰书问候起居,报告自己行踪,并且把自己在河里捕抓的鲢鱼、鲫鱼脂封,派人送京给老祖母尝鲜;二十二年(1683)秋,康熙陪祖母巡幸五台山,一到上坡地方,皇帝每每下轿,亲自为祖母扶辇保护。