屠杀从美军强攻开始,一直到1942年2月23日美军重新夺回马尼拉结束,大屠杀持续一个月之久,日军前后共屠杀了12.5万菲律宾人,平均每天杀害3000人,其中还包括大量的老人、妇女和儿童。2月4日至2月10日日军在巴石河南岸肆意奸淫屠杀,烧毁教堂和图书馆,将避难所的3000名难民烧死。
1942年2月5日日军下令城中男女分开排列站在街上,然后将男子用机关枪射杀,女子肆意强奸后射杀,来不及杀害的无辜百姓就直接用手榴弹爆炸,最骇人听闻的,日军在圣保罗大学通过点心哄骗孩子们聚集在一起,然后引爆事先藏好的炸弹,将994名菲律宾儿童一次性杀害。
马尼拉战役日军共战死约1.2万人、美军战死约1000余人,受伤5000多人,其中平民老百姓死约10万人至15万人之间,除了被日军屠杀的人之外,还有一部分是死于双方的交火,马尼拉曾经人口过百万,被称为“东方明珠”,日军撤退之后,已经变成了一座横尸遍野的废墟,这提醒着我们每一个人勿忘历史、珍爱和平。