终于在苏德战争期间,也就是1942年3月19日,盛世才以四弟盛世骐被杀为由,开始与苏联翻脸,后来又大量逮捕共产党员,转而投向南京国民政府。苏联这次失算了,相当气愤,由于事发于苏德战争中,只得忍气吞声。1942年7月9日,苏联驻华大使潘友新见蒋介石,将7月3日莫洛托夫复盛世才函转交一份给蒋介石,其中一一列举盛世才欲出卖新疆、投靠苏联,反对国民政府、反对蒋介石等事实,并说苏联对其做法一直反对,其意在让委座制裁。因此前蒋、盛已沟通多次,关键是蒋介石此刻正要利用盛世才以使中央势力进入新疆,故对潘友新的“举报”反应平淡。
斯大林在抗战时期,利用国民政府大量军队被日军牵制,对中国唐努乌梁海、外蒙古、新疆和东北都曾进行过大规模武装入侵,在1944年还处于苏德战争的苏联与中国共产党支持的新疆伊宁事变,国民政府防止新疆丢掉,调集大批部队“死守大迪化”,因此牵制了国民党第八战区的大量军事力量,此时蒋介石在华南等地投入150多万兵力与日军打豫湘桂战役。在1945年8月9日,也就是日本投降的前几天,苏联才宣布出兵东北,对日宣战。并强占东北不撤军,因为此前在日本的经营下,东北的工业是亚洲第一,斯大林声称要将东北80%的重工业作为战利品,与中国一起经营,结果被国民政府拒绝。国民政府派张莘夫接受被苏军控制的东北煤矿,在返回途中被八路军第8旅枪杀。此后,苏军在东北强行将运营中的工厂大量拆走,直到1946年初,从东北掠夺的财富就多达13亿美元,不含白银、白金、钻石等,远远超过当时中国GDP的三分之一。