全能神教在基督教的基础上吸收了佛教的轮回观，认为灵魂轮流投胎。他们的目的不是要上天堂，而是除去人类身上被撒旦败坏的性情，在“全能者”“女基督”的带领下进入“国度时代”，回到伊甸园。所以招远邪教徒打死人时喊“恶魔”“永世不得超生”，“恶魔”是基督教的说法，“永世不得超生”则是佛教的说法。
全能神教还“发展”了基督教的教义。基督教有一个难以自圆其说的教义，即圣父、圣子、生灵“三位一体”，他们是三个不同的位格，但是并不是三位不同的神，由于基督教是一神论，他们只能是同一个神。这就是说，耶稣既是神的儿子，又是神本人。如果我们说一个人既是他自己，又是他的儿子，当然是自相矛盾的说法。所以只要能够有一点独立思考，就很快会发现“三位一体”的说法很荒谬。
在基督教历史上，时不时地会出现神学家质疑“三位一体”。他们从两方面入手来解决“三位一体”的矛盾。一个做法是否认耶稣是神，认为他只是神的儿子、神的先知，但不是神，这就避开了耶稣既是神又同时是神的儿子的矛盾。另一个做法是认为“一位一体”，圣父、圣子、圣灵是同一个位格。李常受就是采取这种做法。全能神教更进一步地，认为圣父、圣子只是同一个神在不同时期的表现。
他们认为世界历史有六千年，分为三个时代。第一个时代是律法时代，即《旧约》的时代，神的名字叫耶和华，讲惩罚。第二个时代是恩典时代，即《新约》的时代，神的名字叫耶稣，讲救赎。第三个时代是国度时代，是从上个世纪90年代基督第二次道成肉身开始的末日时代，神的名字叫全能神，是个女基督，讲审判。在2012年12月，由于“世界末日”的传言，其教主赵维山躲在美国号召教徒公开在中国大陆示威。“世界末日”没有来，他们认为是因为他们的祷告和奉献使得“全能神”拯救了世界。
