1856年第二次鸦片战争爆发,英法联军攻陷广州,把两广总督行署夷为平地。1861年,中法不平等条约规定,法国人可以在通商各口岸租地自行建立礼拜堂。
当时罗马教廷任命的两广教区“宗教监牧”传教士明稽章看中了被夷为平地的两广总督行署地基,要求清廷划拨建立教堂,但两广总督劳崇光拒绝了他的要求,于是明稽章请法军司令出面,写信威胁劳崇光如果1天以内不给土地,法军将实行全城戒严,于是恭亲王奕忻与法政府鉴署附加协议确定广州圣心大教堂的地址,咸丰帝下诏批准了协议。
明稽章回法觐见法皇拿破仑三世,得50万法郎专款。圣心大教堂土于1861年8月26日动工,并在1863年12月8日举行了盛大的奠基典礼。明稽章还专门从罗马和耶路撒冷各运来泥土一公斤,表达天主教创立于东方之耶路撒冷,兴起于西方之罗马。教堂东侧墙角下“JERUSALEM1863”和西侧墙角下的“ROME1863”刻字依然清晰可见。