靠山倒台后遭长期软禁
后来纳吉布拉在戈尔巴乔夫帮助下一度出任阿富汗总统，但是好景不长，1991年苏联发生了“8.19”政变，国内局势动荡，根本无暇顾及纳吉布拉，随后苏联解体，阿富汗形势突变。1992年4月，纳吉布拉的爱将杜斯塔姆阵前倒戈，放反政府军进入喀布尔。危急中，纳布吉拉用飞机将家属送到印度新德里，自己却没来得及出逃，只好藏匿在联合国驻喀布尔办事处。反政府军首领知道纳吉布拉在国际上有一些声望，因此只是派士兵团团围住办事处，将他软禁了4年。
最终被塔利班残忍处死
在纳吉拉布被软禁期间，阿富汗局势又发生了翻天覆地的变化，***原教旨主义的塔利班势力蓬勃兴起，横扫国内一切反对势力，并于1996年9月攻入了喀布尔，封锁了该市。在塔利班看来，纳吉布拉这个“屠夫”是地道的傀儡，标准的“内奸”，必须严惩。
当时联合国副秘书长古尔丁正在喀布尔，他希望能帮纳吉布拉离开喀布尔。古尔丁带着阿拉伯文版的《联合国宪章》面见塔利班领导人，希望他们能尊重人权，不要滥杀。塔利班领导人研究了《联合国宪章》，但是终究没有理会他的建议。
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最终，塔利班士兵找到了纳吉布拉的藏身之处，咆哮着冲进去将纳吉布拉抓住，并根据塔利班理解的***教义进行了审判，判决纳吉布拉死刑。之后就出现了文章开头那可怕的一幕，接着他的尸体被悬挂在城市广场的灯柱上示众，一周后，纳吉布拉腐烂得面目全非的尸体被扔进了臭水沟。
