以枪追人 归案于陈义雄
警方之所以认定陈义雄是枪击案的凶手，是因为从当时成立的委员会中，抓到了”以枪追人”的重要线索。警方针对当天凶手可能使用的枪枝型号开始追查，并找到一名叫做唐守义的黑道份子，也从口供中得知购买枪枝的是陈义雄的姊夫。透过这样的方式，警方查出凶手可能是陈义雄，而这也是警方认定的第一个证据。
其次，则是案发地点的监视器影像。警方从当时的影像中发现，有一个黄衣秃头男跟黄义雄非常相似，于是就口供及监视器影像的左证，认定陈义雄极有可能是枪击案的凶手。
另外有个插曲是，陈义雄曾参加台湾TVBS频道”2100全民开讲”的节目录影，这个节目除了可以透过电话播打进去参与讨论外，有时候也会是户外录像的型态。有一天节目在台南做现场录像的时候，有一个人站出来骂了陈水扁，后来经过印证就是陈义雄本人，检分也因此认定他心里面对陈水扁是不满的，加上唐守义的口供跟监视器画面，认定陈义雄即为凶手。
然而后来发现事实是有出入的，陈义雄本身的水性非常好，但他却是溺毙的，而且是有一个渔网将他整个人网住，这样的死法是很启人疑窦的。而到目前为止，也有很多人认为当初检方的笔录有很大的问题，应该针对这案件重启调查。
扁政府抵制真调会与调查三大突破
319枪击案发生之后，连战跟宋楚瑜即带着民众走上街头，当时的台湾已经濒临可能发生暴动的局面，于是美国出面协调，声称要让枪击案的真相厘清，因此后来便成立了”真相调查委员会”。但陈水扁当局并不配合，甚至申请释宪，认定”真调会”是一个不合法的机构。直至”真调会”第二次再度成立的时候，仍不断的使用行政抵抗权，致使王清峰这些”真调会”的委员要到”台南地检署”去查案子都非常困难，除了相关单位不愿意配合，甚至连调查经费都没有。于是某些委员便自己卖书，自己筹措资金，都是为了想把案子查清楚。
