1959年，他每天仅食一餐，餐中的主要食物是南瓜叶、丝瓜叶、红苕藤、牛皮菜及柏枝、树叶、草根等。但他仍然坚持念经修道，并为周围的群众看病治病。
1960年，地方干部又一次以老人"到处乱跑，非法活动，搞一贯道"为理由，动用竹板、钢钎等。残酷地毒打这位80余岁的老人。他们强迫老人承认"罪行"，要老人写"悔过书"，老人被打得遍身是血。
1962年，个别干部又纠集一帮人，再次非法斗争、毒打李真果。老人被打得遍体伤痕，头发被扯落，鲜血流淌。事后，有人问老人:"他们如此凶残地打你，你为什么不还手？”李真果回答:"我连蚂蚁虫子都不伤害，怎么能够还手呢?这也是魔，也是冤孽啊!"
1966年，"文化大革命"的灾难降临中国，李真果陷入更大的苦难之中。从"文革"开始，直到结束，整整10年的时间，他被无端戴上"一贯道”、"历史反革命"、"杀人犯"、"现行反革命"、"管制分子。、"封建迷信头子"“大骗子"等数顶 帽子，经常被关押、批斗、毒打、辱骂，多次将李真果打得昏死过去。他们用竹板打，用布包上秤砣打，用棍棒、钢钎打。打老人的头颅，抓老人的头发，踢老人的下身。总之，横下心把老人往死处打，老人鲜血淋漓，头发抓脱，胡须也被扯落，牙齿被颗颗打落，颅骨下陷，左臂骨折断裂，令人惨不忍睹。
