当时身体虚弱，行走困难，重病缠身。但他检举的决心更加坚定，决心豁出去了，先后上百次到北京反映问题。 1999年8月，党中央开展“三讲”学习活动，中央“三讲”教育巡视组的阴法唐同志到河北巡视，不少干部群众反映程维高的问题，引起他的重视。在中纪委的过问下，2000年，郭光允恢复党籍，但保留党内警告处分。随着中纪委对程维高问题的立案调查，郭光允的问题也真相大白。2003年2月，石家庄市直工委向郭光允道歉，撤销党内警告处分。8月9日，中纪委宣布对程维高严重违纪问题的处理决定，程维高被开除党籍，开除公职。 8月8日，郭光允从在北京工作的儿子那里听到一些风声，害怕有记者找上门来，决定到石家庄市冠心病监护病房住院，并一再告诫医生护士不要暴露他的身份给外界。当时他考虑，党中央一定会正确处理程维高的问题，自己再去多说多讲，万一讲得不对不好，即便是事实但“宣传的口径”不对，造成什么不好的影响，把事情闹大了，对党对国家对自己都没有什么好处。
但三天之后就有记者找到病房里来，开始他还推脱搪塞，后来每天的记者都是一屋子一屋子的，让他觉得再沉默下去就太不近人情了。而话匣子一打开，就收不住了，16年啊，他的冤屈，他的磨难，他的血泪……后来，他干脆写了本书，《我告程维高》。
怕见人间不平事 当时有人建议郭光允申请国家赔偿，如果申请，应该是会得到赔偿。但郭光允考虑，既然党中央已经处理了程维高的问题，给自己平了反，作为共产党员再去申请什么国家赔偿，总觉得不太合适。有人也建议他去起诉程维高，起诉他动用专政手段迫害公民，非法拘禁，打击报复，郭光允一度想过，但考虑再三，觉得解决程维高的问题还是要依靠党，个人没必要再另搞一套。有人建议他发起成立一个反腐败协会，他也婉言谢绝了。 当时中纪委对郭光允的行为给予了很高评价：“正是郭光允同志义无反顾地举报，坚持不懈地揭发，使程维高案件初露端倪。”中纪委领导曾亲笔批示，对郭光允的问题要“彻底平反，不留尾巴”。但时至今日，郭光允没有被完全彻底地落实政策，很难解决个人正当的待遇问题。 1997年郭光允是保外就医离开劳教所的，他多次要求公安部门给他出一份彻底平反的《解除劳教书》，但直到今天也没有得到。
