从此以后只相信武则天的话，不再听信皇后的话，渐渐有了废掉皇后，改立武则天为后的意思，只是由于大臣们反对，一时未能下定决心。
武则天见时机已到，就诬告王皇后与其母柳氏诅咒，同时她的亲信又上表，以偏言激怒高宗，终于取代了王氏，登上了皇后的宝座。
王皇后和萧良娣被囚禁到宫中一座院落内。有一天，唐高宗偶然来到这里，见到门禁严固，饮食都是从小洞中送入，想起往日的情谊，不觉有些伤感，叫道：“皇后、良娣，你们无恙吧?还活着吗?”
两人在里面听到高宗的声音，流着泪哭道：“我们因罪被弃，哪里还是什么皇后、良娣?陛下若念旧情，使我们九死复生，重见天日，就请将这里改名‘回心院’吧。”高宗沉吟道：“我自会处置的。”
武则天得知这事后，恐怕她们二人重新获宠，忙派心腹矫诏去将二人害死。王皇后见到诏旨，知道武则天要下毒手，向着高宗的住处下拜道：“陛下万年!武昭仪得宠，我必死无疑。”
萧良娣则破口大骂：“武氏狐媚，颠倒乾坤!我死后将化作厉猫，让武氏为老鼠，我一定要报此仇!”两人各被杖刑一百，然后砍去手足，接着投到大瓮之中，被折磨数日才死。
按照武则天的说法，是要“令二妪骨碎”。她还命改王皇后姓蟒，改萧良娣姓枭。她虽然用残酷刑法除掉了后宫的劲敌，但萧良娣死前那番话却令她毛骨悚然。
从此，她下令宫中不许养猫，又经常在梦中见到王皇后和萧良娣披头散发，满面是血，前来索命。吓得她不敢再住在宫中，只好长住到洛阳去。
