1984年,21岁的程晓健毕业后志愿到鄂西北偏远山区某应急机动作战部队,历任航空兵团副团长、航空兵师副参谋长、指挥所副参谋长、航空兵师副师长等职。
2001年底,程晓健晋升为特级飞行员;2005年在中俄联合军演中作为中方空军代表参加演习。
曾参与98抗洪、汶川地震抢险救灾
程晓健曾多次参与抢险救灾。1998年,湖北公安县数万名群众被洪水围困,程晓健指挥架运输机飞赴抗洪一线。2008年汶川地震期间,时任中国空军航空兵某部副师长的程晓健,作为空军抗震救灾指挥中心的协调员出色完成任务。
2009年4月,46岁程晓健被任命为驻蓉运输航空兵某师师长,成为新中国成立以来空军第一位女师长。
有趣的是,2011年3月,程晓健在接受采访时曾透露,自己梦想过飞歼击机,此后却当上了运输机部队的师长。
不过,程晓健说,“能飞上天,去完成艰巨的任务,就很光荣,跟飞机的大小无关,跟歼击机和运输机机型也无关,飞行是一种任务、责任和使命。”
“空军远程投送能力是中国空军必须具备的一种能力。”她强调。
当时,程晓健称,“就目前来说,运输机在和平时期也好,在未来的战争中也好,远程投送或战略投送能力是一种需求,是必须达到的一种能力,它在战争中的优点会慢慢凸显。”